فعالیت‌های عمده آموزشگاه‌های علمی مبتکران شامل موارد زیر است:

1- تشکیل کلاس‌های پیشرفت تحصیلی (ویژه دانش آموزان برتر و آمادگی تیزهوشان) در دوره‌های ابتدایی ، متوسطه اول و متوسطه دوم با استفاده از بهترین‌ دبیران و مؤلفان مبتکران؛
2- نمایندگی آزمون‌های مبتکران در شهر تهران؛

3- نمایندگی فروش کتاب و محصولات الکترونیکی مبتکران.

امکانات آموزشگاه‌های علمی مبتکران

آزمون‌های آزمایشی
شرکت در آزمون های آزمایشی بر اساس برنامه، دریافت کارنامه، مشاوره تحصیلی، برخی از خدمات آزمون مبتکران است.

مشاوره‌ی تحصیلی
در آموزشگاه علمی مبتکران، مشاوران تحصیلی، فعالیت های آموزشی دانش‌آموزان را رصد می کنندو برای پیشرفت و شکوفایی تحصیلی آن ها، راه کارهای مناسب ارائه می دهند. بهره مندی از مشاوره تحصیلی برای همه دانش آموزان توصیه می شود.

کلاس‌ها
تشکیل کلاس‌ها ویژه دانش‌آموزان مقطع ابتدایی، متوسطه اول و متوسطه دوم. برگزاری آزمون تعیین سطح قبل از شرکت در کلاس، تشکیل کلاس‌های ویژه تیزهوشان، کلاس‌های آمادگی المپیاد ریاضی نوجوانان، کمک مشاوران کارآمد به دانش‌آموزان در زمینه‌ی برنامه‌ریزی درسی، هماهنگی کلاس‌ها با زمان‌بندی آزمون‌های مبتکران، بهره‌مندی دانش‌آموزان از خدمات کارنامه مبتکران.